手机浏览器扫描二维码访问
宋河顺手开了一个新程序,按伊雷马实验室数据,同步复现药物预测流程。
别人做的成果,他不敢全盘接收,还是亲自上手验证一下稳妥!
首先是经典的ddIs预测,即药物-药物相互作用,探讨病人短时间服用多种药物后,产生的复合效应。
当初在京海大学实验室,吕承恩讲过中药预测五原则,相反为制、相畏为制、相喜为制、相资为制、相恶为制,也是药物和药物相互作用的原理,只不过现代的ddIs预测深入到分子层面了。
之前宋河看相关论文时,见过基于图卷积神经网络的ddIs预测,以及基于平衡理论的预测。
前者太片面,只考虑邻接矩阵元素。
而后者则太绝对,总结起来就是“朋友的朋友是朋友”
、“朋友的朋友是敌人”
,但实际的药物研发中,关系远比平衡理论要错综复杂。
电脑屏幕上,伊雷马实验室居然两种方法都弃之不用,赫然使用了新方法进行ddIs预测!
宋河研读许久,基本明白了思路……大数据库推导!
伊雷马实验室尝试将海量化合物进行拓展,梳理出亲戚关系,画出一个壮观的树状图,每个枝丫都连接一种相似的化合物。
之后,再通过已经确定的化合物药用特性,大胆猜测未知化合物的药效。
这感觉好比,知道丈夫是生物学家,知道妻子是短跑运动员,于是便猜测这对夫妻将来的孙子能够……一边短跑冲刺一边手拿显微镜观察细菌……
本质上还是瞎猜药物,但在瞎猜中多了一丝丝牵强附会的推理。
“好难!”
宋河吐槽。
他在帖子里寻找伊雷马实验室用的大数据库。
找了半天……没找到?
“怪不得呢!
原来公布的只是边缘数据,最核心的没公布啊!”
宋河摇头失笑。
没办法,他只得尝试自己搜集数据库。
他先在网上寻找,用过相似工作方式的科研团队。
花了许久,总共找到两个。
一个是千度公司合作的研发团队,通过大量食管癌病人的数据,寻找到22个显着突变基因,随后预测关联出可行的药物信息。
一个是mSK癌症中心,开发了一个体细胞突变相关的知识库,收录了大量靶向药。
“都是做癌症的数据库,用不上啊!”
宋河挠头。
思前想后,他掏出手机,找相晓桐老师场外求助。
“老师,我需要一个安眠药相关的大数据库,做药物预测用,您知道从哪能弄到吗?学生万谢!”
刚发消息,宋河马上后悔,大半夜的,会不会打扰老师休息?
番茄继吞噬星空莽荒纪雪鹰领主后的第九本小说。在这个世界,有狐仙河神水怪大妖,也有求长生的修行者。修行者们,开法眼,可看妖魔鬼怪。炼一...
考古系博士生朱钧穿越大业,成为六皇子。本以为可以就藩当个逍遥小藩王。却没想到,前身是个疯子,还是应天府八害之首!百姓朱钧那厮无耻之尤,乃应天八害之首!兄弟我大哥忠肝义胆,为兄弟两肋插刀!百官朱疯子离经叛道,坏事做尽,让皇室蒙羞!太子吾弟纯善,有赤子之心!敌人朱疯子比蒙元人更凶,比豺狼更狠,乃一生之敌!燕王我幼弟心思单纯,犹如羊羔也!红颜朱疯子,你到底还有几个好妹妹?皇帝我儿忠勇无双,有大帝之姿,这皇帝,你不做也得做!...
王清歌穿越到平行世界,一名被家人赶出家门,又被女友分手的废物身上,并获得了娱乐逆袭系统。从此这个世界少了个废物,多了个娱乐天王,作曲天才,他的每一首歌总能让无数人闻之泪目。别人对他的评价,永远只有一句,那就是他到底被多少人伤过?他到底经历过什么样的事。在怎样的绝境下,才能写出如此伤感又动听的歌曲来。...
外公留下的青铜器物竟然是上古大巫遗物!初级医师十八年修炼一朝觉醒,得祖巫传承,传承自上古的巫术与现代医术结合,造就新一代神医!能活死人肉白骨,也能追魂夺命!...
林小月在婚前被男友劈腿。酒吧买醉,破坏了神秘男人的好事。她醉意朦胧指着对方就你了,试婚吧。一觉醒来竟莫名签下试婚合同。从此,与人共居的生活一团乱麻。后来,他把她宠上天,她猛然惊醒你干嘛?试爱。...
二十一世纪特种兵花楹执行任务时,被炸身亡。醒来第一眼就差点被吃掉。惊魂未定发现自己连男朋友都没交过,就成了大肚婆,未出世的孩他爹还是个傻子。还好手握亿万空间物资,逃难咱也不怕。基建咱也能搞定。只是这玉矿挖起来有点儿麻烦!这边做着首富的梦,那边频频被追杀。既然你们不长眼惹到她,她也只好大发善心的教教你们做人的道理。让他们知道什么是,武功在高也怕菜刀。等下,那些人为什么这么怕她的傻夫,就连皇帝也...